南京大部分地区通行南京官话，又称江淮官话、下江官话，属北方方言，高淳区大部、溧水区南部地区的方言则通行吴语，属南方方言。普通话的基础方言就是北方话（官话）。
南京官话在历史上长期是中国的国家通用语言，金陵雅言以古中原雅言正统嫡传的身份被确立为中国汉语的标准音，并深远地影响到直至今天的中国语言形态，加之六朝（222–589年）以来汉人文化上的优越意识，清代中叶之前历朝的中国官方标准语均以南京官话为标准。
南京地区在六朝之前通行吴语，中原汉族于五胡乱华时期南迁，北方士族带来的洛阳读书音受本地语音影响形成金陵士音，成为中古汉语音系的代表音之一。明永乐年间迁都北京后，南京话又成为当时北京语音的基础，有明一朝，始终以南京官话为国语正音。
南京官话其影响远及汉字文化圈诸国，周边国家如日本、朝鲜、越南所传授和使用的中国语也是南京官话。明清时期来华的西方传教士所流行的是以南京官话为标准的中国话，民国初年西方传教士主持的“华语正音会”，也以南京音为标准。
吴语，又称江东话、江南话、吴越语，其形成历史追溯到商末，从姬室东迁算起距今3200年历史。吴语来源于上古汉语，周朝先祖周太王长子和次子于太湖流域建立嫡系姬姓诸侯国吴国，江南土著文明与古中原文明融合成先进吴文化；中州人东迁，士大夫性质的魏晋风骨融入吴越，刚烈骁悍的古吴越精神儒化，上古吴语蜕变成中古吴语，江南自此崇文；到明朝吴语发展到达巅峰，民众以说吴语为荣。太平天国战乱及乱后非吴流民涌入、强制推普使吴语临危。
吴语分布于今浙江、江苏南部、上海、安徽南部、江西东北部、福建北一角，使用人口9000多万，是中国七大方言之一。吴语是以上海话为共通语、以苏州音为标准音、以吴语区江南群城方言为基础方言，通行于吴越江南，为吴语区文化情感之认同，为吴越文化之根基，与吴越文化血脉相连。
南京官话主要特征为有入声，入声不分阴阳，而吴语最主要特征就是保留全浊音。两者除语音外用词习惯差异很大，举个栗子，吴语里“喝酒喝水”说成“吃酒吃茶”，“秋裤”说成“棉毛裤”；此外词意也存在不同，再举个栗子，吴语里“晚”不表天已黑，而表黄昏，无“白天晚上/昨晚/晚饭”而是“日里夜里 /昨夜/夜饭”。
